鉄道貨物協会は東京に本部、全国主要都市に支部を置き、全国ネットワークにより効率的な活動を行っています。 全国18支部では常任幹事会・幹事会・地区輸送協議会・地区部会などの会議を開催。鉄道輸送の問題の提案と解決にあたっています。また、講演会・セミナーを開催し、一般社会に鉄道貨物輸送の能力を知って頂く機会を設けています。